Zakład Biologii Molekularnej

Zakład Biologii Molekularnej

• Publikacje Naukowe
• Granty

Kierownik Zakładu
dr hab. n. med. Agnieszka Paradowska-Gorycka, prof. NIGRiR (pobierz plik)
e-mail: agnieszka.paradowska-gorycka@spartanska.pl 

Z-ca Kierownika Zakładu:
dr n. med. Anna Wajda (adiunkt) (pobierz plik)
e-mail: anna.wajda@spartanska.pl

Zespół:

• dr hab. n. med. Piotr Piotrowski (prac. naukowy) (pobierz plik)
• dr n. med. Barbara Stypińska (prac. naukowy) (pobierz plik)
• mgr inż. Ewa Dudek (pobierz plik)
• mgr inż. Tomasz Kmiołek (pobierz plik)
• dr n. med. Ewa Modzelewska (pobierz plik)
• mgr inż. Diana Bogucka (pobierz plik)
• mgr Gabriela Filipowicz (pobierz plik)
• mgr inż. Adam Ejma-Multański (pobierz plik)
• mgr Yana Kaliberda (pobierz plik)

 Główne zadania i kierunki działalności:

1. Prace naukowo-badawcze nad procesem przewlekłego zapalenia oraz procesmi włóknienia.
2. Badania molekularne przewlekłych chorób reumatycznych:

• analiza ekspresji genów
• analiza polimorfizmów
• wpływ wariantów genetycznych czynników transkrypcyjnych i cytokin na patogenezę i asocjacje z przebiegiem choroby
• epigenetyczne mechanizmy wpływające na patogenezę i asocjacje z przebiegiem choroby
• badania interakcji miRNA: mRNA
• badanie modulowania równowagi/różnicowania liczby komórek T

3. Medycyna spersonalizowana – pogłębianie wiedzy na temat bezpiecznej i skutecznej terapii w oparciu o podłoże genetyczne i epigenetyczne, a w konsekwencji opracowanie nowych strategii terapeutycznych dla pacjentów z lekoopornością / innymi efektami ubocznymi.
4. Molekularne mechanizmy procesu starzenia:

• badania na mięśniach szkieletowych – analiza profilu ekspresji genów, ekspresji miRNA
• badania telomerów
• badanie molekularnych aspektów fizjologii komórek mięśniowych
• badanie czynników genetycznych i epigenetycznych
• analiza procesów oksydacyjnych w komórkach

5. Molekularne mechanizmy związane z chorobami układu mięśniowo-szkieletowego

• opracowanie metody diagnozowania sarkopenii na podstawie wyników genetycznych i epigenetycznych, testów czynnościowych i oceny morfologicznej starzejących się mięśni prążkowanych w przebiegu sarkopenii
• analizy przesiewowe w celu wykrycia mikroRNA związanych z sarkopenią
• profil cytokinowy u pacjentów z zespołem kruchości oraz sarkopenią
• opracowanie metody diagnozowania sarkopenii na podstawie wyników genetycznych i epigenetycznych, testów czynnościowych przeprowadzonych we krwi w przebiegu sarkopenii
• poszukiwanie biomarkerów molekularnych różnicujących sarkopenię i zespół kruchości
• rola białka FAM210 w fizjologii mięśni i patogenezie sarkopenii

 Techniki badawcze oraz aparatura specjalistyczna:

1. Analiza ekspresji genów (nCounter Dx Analysis System firmy Nanostring, QuantStudio 5, QuantStudio 1, droplet digital PCR (ddPCR)
2. Sekwencjonowanie i analiza wariantów genetycznych (QuantStudio 5, QuantStudio 1, droplet digital PCR (ddPCR), MySeq)
3. Techniki immunochemiczne: ELISA, Western blotting, cytometria przepływowa (VARIOSKAN LUX, IBRIGHT CL1500 Imaging System, FACSCelesta)
4. Oznaczanie białek oraz aktywności enzymatycznej i kinetyki reakcji (FLOID Cell imaging station, VARIOSKAN LUX)
5. System do transfekcji komórek (Neon System)
6. Aparatura pomocnicza: Denovix, Denovix, Agilent

Unikatowa aparatura: nCounter Dx Analysis System firmy Nanostring

Doktoraty, habilitacje, profesury:

• doktoraty – 11
• habilitacje – 2
• tytuły profesorskie – 1

W ciągu ostatnich 5 lat realizowaliśmy 7 projektów naukowych oraz 5 projektów komercyjnych.

Współpraca krajowa i zagraniczna

Zakład Biologii Molekularnej NIGRiR współpracuje naukowo z poniższymi jednostkami:

1. Katedra i Klinika Chorób Wewnętrznych, Chorób Tkanki Łącznej I Geriatrii Gdańskiego Uniwersytetu Medycznego;
2. Uniwersytet Medyczny im. Karola Marcinkowskiego w Poznaniu;
3. Zakład Farmakologii Doświadczalnej i Klinicznej, Pomorski Uniwersytet Medyczny w Szczecinie;
4. Instytut Immunologii i Terapii Doświadczalnej im. Ludwika Hirszfelda Polskiej Akademii Nauk, prof. dr hab. Katarzyna Bogunia-Kubik;
5. Narodowy Instytut Leków;
6. Zakład Histologii i Biologii Rozwoju, Pomorski Uniwersytet Medyczny w Szczecinie;
7. Katedra i Zakład Fizjologii, Pomorski Uniwersytet Medyczny w Szczecinie;
8. Pracownia Biobanku, Wydział Biologii i Ochrony Środowiska, Uniwersytet Łódzki, Łódź;
9. Leibniz Institute for Environmental Medical Research, Dusseldorf, Niemcy
10. Leibniz Research Institute for Environmental Medicine w Düsseldorfie;
11. Experimental and Observational Rheumatology and Rheumatology Unit, Instituto de Investigación Sanitaria – Hospital Clínico Universitario de Santiago, Travesia Choupana sn, 15706, Santiago de Compostela, Spain;
12. Institute of Environmental Medicine – IMM, Karolinska Institute, Stockholm, prof. Johan Frostegard;
13. Dept. of Experimental Medicine Systems Biology Group, University La Sapienza, Roma, Italy;
14. Thalassemia and Hemoglobinopathy Research Center, Health Research Institute, Ahvaz Jundishapur University of Medical Sciences, Ahvaz, Iran.

Kontakt

Zakład Biologii Molekularnej
ul. Spartańska 1
02-637 Warszawa
tel. +48 22 670 93 91/92/93
e-mail: zaklad.biochemii@spartanska.pl